Classé monument naturel national, le mont Misen abrite une végétation unique, composée d'un mélange d'espèces méridionales, de conifères et de plantes primitives restées intactes. On y observe une grande variété de plantes, notamment des espèces tempérées, des plantes tempérées boréales comme les conifères, et des plantes primitives. Le site, inscrit au patrimoine mondial, s'étend sur 431,2 hectares et comprend le sanctuaire d'Itsukushima, la mer en face et la forêt primaire de Misen en arrière-plan. Il a été inscrit en tant que site composite, alliant le patrimoine culturel du sanctuaire d'Itsukushima et de la mer, et le patrimoine naturel, dont la forêt primaire de Misen.